Radiorésistance de lignées cellulaires humaines de gliobastomes : recherche de bloqueurs par métabolomique, lipidomique et transcriptomique

Les glioblastomes (GBM) sont les tumeurs cérébrales humaines les plus agressives. Les personnes atteintes de cette maladie meurent généralement dans l'année suivant le diagnostic. La radiothérapie, qui est de plus en plus utilisée en présence d'un agent radiosensibilisant, est systématiquement appliquée afin de diminuer la progression tumorale. Néanmoins, elle se heurte au phénomène de radiorésistance. Afin de proposer dans un avenir proche une thérapie adaptée à chaque patient, une classification moléculaire des GBM est en train de naître. Celle-ci tient notamment compte d'un biomarqueur prédictif de chimiorésistance, mais non de radiorésistance. Dans ce contexte, nous avons cherché, dans un premier temps, à identifier in vitro de potentiels biomarqueurs de radiorésistance dans quatre lignées cellulaires humaines de GBM de radiosensibilité différente. Pour cela, nous avons eu recours à des méthodes analytiques holistiques et robustes telles que la RMN 1H métabolomique, la lipidomique et la transcriptomique. Une accumulation de composés à choline dans les deux lignées les plus radiorésistantes a ainsi été mise en évidence. Une méthode d'analyse du métabolisme des phosphatidylcholines par marquage deutéré et quantification par HILIC-ESI-MS/MS a été mise au point afin de confirmer ces résultats. Dans une seconde partie, nous avons cherché à identifier in vitro de potentiels biomarqueurs de mort radio-induite dans des lignées cellulaires humaines de GBM radiosensibilisées. La RMN 1H métabolomique a été privilégiée pour cette investigation et complétée par des études lipidomique et de mort cellulaire par cytométrie en flux pour l'un des projets. La taurine a ainsi été identifiée comme potentiel biomarqueur de mort cellulaire.Glioblastomas (GBM) are the most aggressive human brain tumors. Indeed, patients most often die within the year after the diagnostic. Radiotherapy generally associated to radiosensitizers is currently systematically used to reduce tumor progression. Nevertheless, a radioresistance phenomenon still occurs. An individual treatment is hoped for each patient. For this purpose, a molecular classification of GBM has been created, taking into account biomarkers such as a predictive chimioresistance factor, but not radioresistance one. In this context, we have searched for in vitro radioresistance biomarkers in four human GBM cell lines with different radiosensitivity profiles. This corresponds to the first part of the PhD manuscript. Comprehensive and robust analytical methods such as 1H NMR metabolomics, lipidomics and transcriptomics have been used. An accumulation of choline compounds has been observed in the two more radioresistant cell lines. An analytical method using deuterated labelling and HILIC-ESI-MS/MS has been developed to study the metabolism of phosphatidylcholines in the four cell lines. In the second part of the PhD project, we have focused on potential in vitro biomarkers of radio-induced cell death in radiosensitized human GBM cell lines. For this, NMR 1H metabolomics has been chosen. Taurine has been found as a good candidate in a cell line. Lipidomics and FACS analyses have then been used to confirm this result

Radiorésistance de lignées cellulaires humaines de gliobastomes (recherche de bloqueurs par métabolomique, lipidomique et transcriptomiques)

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